MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Heliobacterium modesticaldum Ice1 chromosome

Total Repeats: 66269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010337	C	6	6	26	31	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_010337	GCA	2	6	111	116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010337	GTG	2	6	176	181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010337	AGA	2	6	201	206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010337	CTG	2	6	228	233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010337	CAAA	2	8	278	285	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010337	GGT	2	6	300	305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010337	T	7	7	305	311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010337	AGC	2	6	319	324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010337	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010337	AAG	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010337	A	8	8	372	379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010337	ACG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628138
14	NC_010337	ATC	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628138
15	NC_010337	TGG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628138
16	NC_010337	TCC	2	6	516	521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628138
17	NC_010337	GTT	2	6	599	604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628138
18	NC_010337	CATC	2	8	640	647	25 %	25 %	0 %	50 %	167628138
19	NC_010337	T	6	6	774	779	0 %	100 %	0 %	0 %	167628138
20	NC_010337	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
21	NC_010337	ATC	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628138
22	NC_010337	TCA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628138
23	NC_010337	CCA	2	6	958	963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628138
24	NC_010337	TCCGC	2	10	1082	1091	0 %	20 %	20 %	60 %	167628138
25	NC_010337	GAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
26	NC_010337	GCG	2	6	1134	1139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628138
27	NC_010337	CAG	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628138
28	NC_010337	CCAGA	2	10	1176	1185	40 %	0 %	20 %	40 %	167628138
29	NC_010337	TCC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628138
30	NC_010337	GAT	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
31	NC_010337	GAAG	2	8	1243	1250	50 %	0 %	50 %	0 %	167628138
32	NC_010337	ATG	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628138
33	NC_010337	CTTC	2	8	1348	1355	0 %	50 %	0 %	50 %	167628138
34	NC_010337	CAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628139
35	NC_010337	C	6	6	1485	1490	0 %	0 %	0 %	100 %	167628139
36	NC_010337	A	7	7	1491	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	167628139
37	NC_010337	TAT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628139
38	NC_010337	TTG	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628139
39	NC_010337	T	6	6	1568	1573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010337	AGG	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628140
41	NC_010337	ATT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628140
42	NC_010337	TCC	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628140
43	NC_010337	AGAA	2	8	1768	1775	75 %	0 %	25 %	0 %	167628141
44	NC_010337	GGA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628141
45	NC_010337	AAGG	2	8	1802	1809	50 %	0 %	50 %	0 %	167628141
46	NC_010337	AGA	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628141
47	NC_010337	CGA	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628141
48	NC_010337	AGC	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628141
49	NC_010337	CGG	2	6	2101	2106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628141
50	NC_010337	CAC	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628141
51	NC_010337	TTG	2	6	2146	2151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628141
52	NC_010337	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628141
53	NC_010337	CTT	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010337	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010337	CCG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628142
56	NC_010337	TC	3	6	2272	2277	0 %	50 %	0 %	50 %	167628142
57	NC_010337	GAT	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628142
58	NC_010337	TCG	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628142
59	NC_010337	GC	3	6	2335	2340	0 %	0 %	50 %	50 %	167628142
60	NC_010337	GTTC	2	8	2388	2395	0 %	50 %	25 %	25 %	167628142
61	NC_010337	GGC	2	6	2419	2424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628142
62	NC_010337	T	6	6	2431	2436	0 %	100 %	0 %	0 %	167628142
63	NC_010337	AAG	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628142
64	NC_010337	T	6	6	2500	2505	0 %	100 %	0 %	0 %	167628142
65	NC_010337	CAT	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628142
66	NC_010337	GAT	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167628142
67	NC_010337	CTC	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628142
68	NC_010337	GAC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628142
69	NC_010337	GCC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628142
70	NC_010337	CAT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628142
71	NC_010337	GCC	2	6	2738	2743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628142
72	NC_010337	AGG	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167628142
73	NC_010337	T	6	6	2988	2993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010337	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010337	AGG	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010337	CTGC	2	8	3115	3122	0 %	25 %	25 %	50 %	167628143
77	NC_010337	AGA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628143
78	NC_010337	GCT	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
79	NC_010337	CTG	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
80	NC_010337	GCC	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
81	NC_010337	CCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
82	NC_010337	CCG	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
83	NC_010337	GCT	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
84	NC_010337	CCG	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
85	NC_010337	CCG	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
86	NC_010337	CCG	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
87	NC_010337	CGC	2	6	3413	3418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
88	NC_010337	CGC	2	6	3422	3427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
89	NC_010337	GCT	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
90	NC_010337	CGC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
91	NC_010337	CGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
92	NC_010337	CCG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
93	NC_010337	GCT	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
94	NC_010337	GTC	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
95	NC_010337	GCC	2	6	3555	3560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
96	NC_010337	ATCGG	2	10	3594	3603	20 %	20 %	40 %	20 %	167628143
97	NC_010337	GCC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
98	NC_010337	CGC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
99	NC_010337	ACTGC	2	10	3706	3715	20 %	20 %	20 %	40 %	167628143
100	NC_010337	GAA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628143
101	NC_010337	TGC	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628143
102	NC_010337	A	6	6	3900	3905	100 %	0 %	0 %	0 %	167628143
103	NC_010337	GCC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
104	NC_010337	ATC	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628143
105	NC_010337	TCA	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628143
106	NC_010337	GCC	2	6	3964	3969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628143
107	NC_010337	TCA	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167628144
108	NC_010337	ACAG	2	8	4138	4145	50 %	0 %	25 %	25 %	167628144
109	NC_010337	ACG	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628144
110	NC_010337	ATTCC	2	10	4262	4271	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_010337	CGA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010337	AAT	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010337	CGC	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010337	TCCC	2	8	4370	4377	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_010337	C	6	6	4375	4380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_010337	CCG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628145
117	NC_010337	CGA	2	6	4605	4610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628145
118	NC_010337	TGG	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628145
119	NC_010337	GCC	2	6	4721	4726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167628145
120	NC_010337	TCG	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628145
121	NC_010337	CCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628145
122	NC_010337	GTT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628145
123	NC_010337	CTT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167628145
124	NC_010337	TGG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167628145
125	NC_010337	TGC	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628145
126	NC_010337	CTC	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167628145
127	NC_010337	GGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
128	NC_010337	CAAG	2	8	5091	5098	50 %	0 %	25 %	25 %	167628145
129	NC_010337	GAA	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628145
130	NC_010337	GAA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167628145
131	NC_010337	TGT	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628145
132	NC_010337	GCA	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167628145
133	NC_010337	TGC	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167628145
134	NC_010337	CGG	2	6	5463	5468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
135	NC_010337	GCG	2	6	5474	5479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
136	NC_010337	GCG	2	6	5522	5527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167628145
137	NC_010337	ACC	2	6	5543	5548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167628145
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266	NC_010337	A	6	6	12232	12237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010337	A	6	6	12265	12270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_010337	TAT	2	6	12407	12412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167628153
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271	NC_010337	TTG	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167628153
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277	NC_010337	T	6	6	12839	12844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_010337	TTA	2	6	14911	14916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_010337	TGTCA	2	10	18966	18975	20 %	40 %	20 %	20 %	167628164
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